如果这些程序是要执行的，那么需要设置“读取”权限，并且设置执行权限为“纯脚本”。不要设置“写入”和“脚本资源访问”，更不要设置执行权限为“纯脚本和可执行程序”。NTFS 权限中不要给 IIS_WPG 用户组和 Internet 来宾帐号设置写和修改权限。如果有一些特殊的配置文件（而且配置文件本身也是 ASP、PHP 程序），则需要给这些特定的文件配置 NTFS 权限中的 Internet 来宾帐号（ASP.NET 程序是 IIS_WPG 组）的写权限，而不要配置 IIS 属性面板中的“写入”权限。

IIS 面板中的“写入”权限实际上是对 HTTP PUT 指令的处理，对于普通网站，一般情况下这个权限是不打开的。

IIS 面板中的“脚本资源访问”不是指可以执行脚本的权限，而是指可以访问源代码的权限，如果同时又打开“写入”权限的话，那么就非常危险了。

执行权限中“纯脚本和可执行程序”权限可以执行任意程序，包括 exe 可执行程序，如果目录同时有“写入”权限的话，那么就很容易被人上传并执行木马程序了。
Bnxb.com发表

对于 ASP.NET 程序的目录，许多人喜欢在文件系统中设置成 Web 共享，实际上这是没有必要的。只需要在 IIS 中保证该目录为一个应用程序即可。如果所在目录在 IIS 中不是一个应用程序目录，只需要在其属性->目录面板中应用程序设置部分点创建就可以了。Web 共享会给其更多权限，可能会造成不安全因素。

总结: 也就是说一般不要打开-主目录-(写入),(脚本资源访问) 这两项以及不要选上(纯脚本和可执行程序),选(纯脚本)就可以了.需要asp.net的应用程序的如果应用程序目录不止应用程序一个程序的可以在应用程序文件夹上(属性)-目录-点创建就可以了.不要在文件夹上选web共享.